Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D1P51668 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D1P51668 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms