Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSEN1P49768 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN1P49768 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN1P49768 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms