Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC1P48547 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNC1P48547 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms