Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGCXP38435 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGCXP38435 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGCXP38435 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GGCXP38435 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGCXP38435 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGCXP38435 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGCXP38435 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGCXP38435 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGCXP38435 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GGCXP38435 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGCXP38435 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGCXP38435 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GGCXP38435 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGCXP38435 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGCXP38435 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGCXP38435 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GGCXP38435 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGCXP38435 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGCXP38435 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGCXP38435 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGCXP38435 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGCXP38435 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GGCXP38435 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGCXP38435 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGCXP38435 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGCXP38435 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGCXP38435 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGCXP38435 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGCXP38435 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGCXP38435 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGCXP38435 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGCXP38435 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGCXP38435 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGCXP38435 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGCXP38435 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGCXP38435 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGCXP38435 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGCXP38435 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGCXP38435 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGCXP38435 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GGCXP38435 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGCXP38435 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGCXP38435 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGCXP38435 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGCXP38435 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GGCXP38435 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGCXP38435 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGCXP38435 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGCXP38435 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGCXP38435 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGCXP38435 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGCXP38435 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGCXP38435 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGCXP38435 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGCXP38435 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGCXP38435 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGCXP38435 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGCXP38435 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGCXP38435 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGCXP38435 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGCXP38435 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGCXP38435 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGCXP38435 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGCXP38435 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGCXP38435 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGCXP38435 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGCXP38435 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGCXP38435 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGCXP38435 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGCXP38435 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGCXP38435 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGCXP38435 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGCXP38435 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GGCXP38435 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGCXP38435 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms