Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGP37231 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGP37231 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGP37231 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGP37231 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGP37231 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGP37231 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPARGP37231 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPARGP37231 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGP37231 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGP37231 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGP37231 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGP37231 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGP37231 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGP37231 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGP37231 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGP37231 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGP37231 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGP37231 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGP37231 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGP37231 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGP37231 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGP37231 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGP37231 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGP37231 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGP37231 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGP37231 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGP37231 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGP37231 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGP37231 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGP37231 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGP37231 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGP37231 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPARGP37231 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPARGP37231 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPARGP37231 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPARGP37231 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGP37231 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGP37231 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGP37231 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGP37231 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGP37231 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGP37231 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGP37231 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGP37231 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGP37231 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGP37231 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGP37231 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGP37231 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGP37231 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGP37231 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGP37231 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGP37231 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGP37231 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGP37231 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGP37231 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGP37231 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGP37231 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGP37231 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGP37231 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARGP37231 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARGP37231 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARGP37231 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGP37231 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPARGP37231 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGP37231 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGP37231 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGP37231 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms