Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDIT3P35638 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDIT3P35638 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms