Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPOP30536 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPOP30536 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPOP30536 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPOP30536 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPOP30536 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPOP30536 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPOP30536 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPOP30536 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPOP30536 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPOP30536 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPOP30536 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPOP30536 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPOP30536 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSPOP30536 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSPOP30536 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSPOP30536 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSPOP30536 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSPOP30536 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSPOP30536 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSPOP30536 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSPOP30536 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSPOP30536 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSPOP30536 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSPOP30536 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSPOP30536 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSPOP30536 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSPOP30536 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSPOP30536 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSPOP30536 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSPOP30536 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms