Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBMS1P29558 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS1P29558 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms