Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL13P26373 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL13P26373 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL13P26373 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL13P26373 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL13P26373 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL13P26373 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL13P26373 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL13P26373 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL13P26373 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL13P26373 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL13P26373 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL13P26373 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL13P26373 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL13P26373 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL13P26373 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL13P26373 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL13P26373 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL13P26373 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL13P26373 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL13P26373 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL13P26373 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL13P26373 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL13P26373 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL13P26373 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL13P26373 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL13P26373 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL13P26373 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL13P26373 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL13P26373 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL13P26373 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL13P26373 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL13P26373 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL13P26373 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL13P26373 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL13P26373 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL13P26373 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL13P26373 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL13P26373 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPL13P26373 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPL13P26373 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL13P26373 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL13P26373 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL13P26373 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL13P26373 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL13P26373 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL13P26373 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL13P26373 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL13P26373 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL13P26373 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL13P26373 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL13P26373 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL13P26373 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL13P26373 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL13P26373 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL13P26373 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL13P26373 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL13P26373 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL13P26373 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL13P26373 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL13P26373 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL13P26373 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL13P26373 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL13P26373 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL13P26373 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL13P26373 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL13P26373 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL13P26373 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL13P26373 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPL13P26373 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL13P26373 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL13P26373 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL13P26373 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL13P26373 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL13P26373 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL13P26373 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL13P26373 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPL13P26373 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms