Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDELR1P24390 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR1P24390 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDELR1P24390 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDELR1P24390 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms