Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SP100P23497 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP100P23497 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP100P23497 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP100P23497 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SP100P23497 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP100P23497 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP100P23497 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP100P23497 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP100P23497 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP100P23497 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP100P23497 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP100P23497 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP100P23497 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP100P23497 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP100P23497 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP100P23497 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP100P23497 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP100P23497 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP100P23497 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP100P23497 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP100P23497 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP100P23497 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP100P23497 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP100P23497 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP100P23497 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP100P23497 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP100P23497 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP100P23497 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP100P23497 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP100P23497 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SP100P23497 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP100P23497 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP100P23497 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP100P23497 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP100P23497 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP100P23497 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SP100P23497 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP100P23497 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP100P23497 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP100P23497 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP100P23497 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP100P23497 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP100P23497 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP100P23497 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP100P23497 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP100P23497 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP100P23497 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP100P23497 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP100P23497 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP100P23497 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP100P23497 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP100P23497 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP100P23497 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP100P23497 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP100P23497 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP100P23497 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP100P23497 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP100P23497 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SP100P23497 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP100P23497 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP100P23497 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP100P23497 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP100P23497 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP100P23497 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP100P23497 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP100P23497 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP100P23497 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SP100P23497 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP100P23497 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP100P23497 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP100P23497 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP100P23497 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP100P23497 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP100P23497 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP100P23497 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SP100P23497 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP100P23497 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP100P23497 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP100P23497 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP100P23497 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP100P23497 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP100P23497 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP100P23497 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP100P23497 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SP100P23497 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms