Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRGP23470 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.82
PTPRGP23470 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRGP23470 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRGP23470 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms