Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCMT1P22061 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms