Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM21P19474 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM21P19474 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM21P19474 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms