Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIG1P18858 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIG1P18858 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIG1P18858 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG1P18858 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG1P18858 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG1P18858 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG1P18858 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG1P18858 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIG1P18858 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LIG1P18858 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LIG1P18858 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG1P18858 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG1P18858 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIG1P18858 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIG1P18858 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG1P18858 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG1P18858 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG1P18858 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG1P18858 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIG1P18858 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIG1P18858 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIG1P18858 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIG1P18858 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG1P18858 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG1P18858 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG1P18858 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG1P18858 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG1P18858 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIG1P18858 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIG1P18858 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIG1P18858 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LIG1P18858 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LIG1P18858 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LIG1P18858 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LIG1P18858 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIG1P18858 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIG1P18858 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIG1P18858 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LIG1P18858 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIG1P18858 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIG1P18858 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LIG1P18858 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIG1P18858 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIG1P18858 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIG1P18858 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIG1P18858 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIG1P18858 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIG1P18858 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIG1P18858 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIG1P18858 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIG1P18858 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIG1P18858 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIG1P18858 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIG1P18858 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIG1P18858 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIG1P18858 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIG1P18858 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIG1P18858 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIG1P18858 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LIG1P18858 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LIG1P18858 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LIG1P18858 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LIG1P18858 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIG1P18858 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIG1P18858 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIG1P18858 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIG1P18858 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIG1P18858 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIG1P18858 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIG1P18858 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIG1P18858 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIG1P18858 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIG1P18858 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LIG1P18858 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIG1P18858 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LIG1P18858 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LIG1P18858 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms