Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCFC2P16383 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCFC2P16383 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCFC2P16383 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms