Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETFAP13804 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETFAP13804 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFAP13804 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFAP13804 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETFAP13804 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFAP13804 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFAP13804 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFAP13804 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETFAP13804 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFAP13804 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFAP13804 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFAP13804 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFAP13804 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFAP13804 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFAP13804 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETFAP13804 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFAP13804 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFAP13804 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFAP13804 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFAP13804 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFAP13804 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFAP13804 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETFAP13804 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFAP13804 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFAP13804 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFAP13804 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFAP13804 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFAP13804 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFAP13804 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETFAP13804 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFAP13804 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFAP13804 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFAP13804 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFAP13804 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETFAP13804 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETFAP13804 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETFAP13804 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETFAP13804 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETFAP13804 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETFAP13804 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETFAP13804 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETFAP13804 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETFAP13804 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETFAP13804 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETFAP13804 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETFAP13804 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETFAP13804 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETFAP13804 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETFAP13804 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETFAP13804 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETFAP13804 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETFAP13804 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETFAP13804 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETFAP13804 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETFAP13804 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFAP13804 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETFAP13804 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms