Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DOBP13765 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms