Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT5P13647 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT5P13647 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT5P13647 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT5P13647 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT5P13647 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT5P13647 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT5P13647 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT5P13647 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT5P13647 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT5P13647 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT5P13647 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT5P13647 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT5P13647 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT5P13647 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT5P13647 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT5P13647 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT5P13647 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT5P13647 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT5P13647 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT5P13647 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT5P13647 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT5P13647 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT5P13647 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT5P13647 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT5P13647 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT5P13647 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT5P13647 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT5P13647 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT5P13647 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT5P13647 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT5P13647 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT5P13647 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT5P13647 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT5P13647 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT5P13647 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT5P13647 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT5P13647 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT5P13647 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT5P13647 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT5P13647 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT5P13647 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT5P13647 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT5P13647 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT5P13647 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT5P13647 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT5P13647 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT5P13647 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT5P13647 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT5P13647 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT5P13647 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT5P13647 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT5P13647 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT5P13647 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT5P13647 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT5P13647 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT5P13647 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT5P13647 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT5P13647 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT5P13647 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT5P13647 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT5P13647 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT5P13647 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT5P13647 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT5P13647 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT5P13647 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT5P13647 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms