Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCG2P13521 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCG2P13521 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCG2P13521 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCG2P13521 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCG2P13521 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCG2P13521 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCG2P13521 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCG2P13521 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCG2P13521 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCG2P13521 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCG2P13521 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCG2P13521 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCG2P13521 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCG2P13521 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCG2P13521 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCG2P13521 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCG2P13521 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCG2P13521 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCG2P13521 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCG2P13521 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCG2P13521 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCG2P13521 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCG2P13521 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCG2P13521 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG2P13521 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG2P13521 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG2P13521 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG2P13521 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG2P13521 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCG2P13521 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCG2P13521 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCG2P13521 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCG2P13521 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCG2P13521 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCG2P13521 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCG2P13521 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG2P13521 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG2P13521 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG2P13521 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG2P13521 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG2P13521 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG2P13521 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG2P13521 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCG2P13521 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCG2P13521 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCG2P13521 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCG2P13521 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCG2P13521 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG2P13521 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCG2P13521 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCG2P13521 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCG2P13521 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCG2P13521 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCG2P13521 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCG2P13521 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCG2P13521 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCG2P13521 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCG2P13521 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCG2P13521 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCG2P13521 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCG2P13521 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCG2P13521 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCG2P13521 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCG2P13521 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SCG2P13521 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCG2P13521 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCG2P13521 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCG2P13521 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCG2P13521 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCG2P13521 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCG2P13521 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCG2P13521 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCG2P13521 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCG2P13521 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG2P13521 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG2P13521 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG2P13521 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG2P13521 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG2P13521 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG2P13521 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG2P13521 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms