Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP10827 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP10827 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP10827 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRAP10827 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP10827 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP10827 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRAP10827 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRAP10827 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP10827 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP10827 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRAP10827 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP10827 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP10827 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP10827 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP10827 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP10827 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP10827 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP10827 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP10827 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP10827 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP10827 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP10827 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP10827 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP10827 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRAP10827 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRAP10827 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THRAP10827 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THRAP10827 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THRAP10827 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THRAP10827 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP10827 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THRAP10827 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP10827 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP10827 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms