Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFC1P0CG37 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFC1P0CG37 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1P0CG37 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms