Protein–RNA interactions for Protein: P07305

H1F0, Histone H1.0, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1F0P07305 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1F0P07305 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1F0P07305 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H1F0P07305 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H1F0P07305 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H1F0P07305 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H1F0P07305 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H1F0P07305 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H1F0P07305 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1F0P07305 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H1F0P07305 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H1F0P07305 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H1F0P07305 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H1F0P07305 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H1F0P07305 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H1F0P07305 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H1F0P07305 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H1F0P07305 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
H1F0P07305 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1F0P07305 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1F0P07305 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1F0P07305 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1F0P07305 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1F0P07305 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1F0P07305 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1F0P07305 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1F0P07305 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1F0P07305 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1F0P07305 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1F0P07305 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1F0P07305 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1F0P07305 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H1F0P07305 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H1F0P07305 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H1F0P07305 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H1F0P07305 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H1F0P07305 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H1F0P07305 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1F0P07305 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1F0P07305 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1F0P07305 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1F0P07305 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1F0P07305 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1F0P07305 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1F0P07305 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H1F0P07305 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H1F0P07305 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H1F0P07305 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H1F0P07305 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H1F0P07305 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H1F0P07305 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H1F0P07305 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H1F0P07305 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H1F0P07305 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H1F0P07305 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H1F0P07305 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H1F0P07305 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H1F0P07305 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H1F0P07305 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms