Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTMAP06454 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTMAP06454 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTMAP06454 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTMAP06454 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTMAP06454 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTMAP06454 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTMAP06454 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTMAP06454 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTMAP06454 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTMAP06454 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTMAP06454 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTMAP06454 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTMAP06454 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTMAP06454 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTMAP06454 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTMAP06454 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTMAP06454 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTMAP06454 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTMAP06454 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTMAP06454 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTMAP06454 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTMAP06454 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTMAP06454 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTMAP06454 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTMAP06454 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTMAP06454 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTMAP06454 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTMAP06454 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTMAP06454 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTMAP06454 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTMAP06454 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTMAP06454 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTMAP06454 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTMAP06454 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTMAP06454 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTMAP06454 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTMAP06454 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTMAP06454 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTMAP06454 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTMAP06454 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTMAP06454 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTMAP06454 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTMAP06454 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTMAP06454 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTMAP06454 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTMAP06454 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTMAP06454 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTMAP06454 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTMAP06454 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTMAP06454 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTMAP06454 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTMAP06454 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTMAP06454 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTMAP06454 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTMAP06454 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTMAP06454 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTMAP06454 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTMAP06454 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTMAP06454 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTMAP06454 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTMAP06454 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTMAP06454 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTMAP06454 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTMAP06454 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTMAP06454 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTMAP06454 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTMAP06454 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTMAP06454 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTMAP06454 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTMAP06454 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTMAP06454 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTMAP06454 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTMAP06454 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms