Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA1P02647 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA1P02647 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA1P02647 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA1P02647 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA1P02647 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA1P02647 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA1P02647 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA1P02647 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA1P02647 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA1P02647 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA1P02647 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA1P02647 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA1P02647 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA1P02647 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA1P02647 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA1P02647 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA1P02647 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA1P02647 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA1P02647 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA1P02647 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA1P02647 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA1P02647 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA1P02647 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA1P02647 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA1P02647 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA1P02647 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA1P02647 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA1P02647 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA1P02647 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA1P02647 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA1P02647 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA1P02647 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA1P02647 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA1P02647 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA1P02647 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA1P02647 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA1P02647 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA1P02647 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA1P02647 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA1P02647 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA1P02647 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA1P02647 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA1P02647 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APOA1P02647 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA1P02647 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA1P02647 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA1P02647 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA1P02647 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA1P02647 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA1P02647 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOA1P02647 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms