Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV3-9P01782 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-9P01782 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms