Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CST1P01037 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CST1P01037 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CST1P01037 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CST1P01037 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST1P01037 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST1P01037 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST1P01037 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CST1P01037 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CST1P01037 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CST1P01037 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CST1P01037 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CST1P01037 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CST1P01037 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST1P01037 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST1P01037 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST1P01037 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST1P01037 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST1P01037 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST1P01037 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST1P01037 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST1P01037 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST1P01037 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST1P01037 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST1P01037 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST1P01037 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST1P01037 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST1P01037 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST1P01037 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST1P01037 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST1P01037 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CST1P01037 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CST1P01037 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CST1P01037 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CST1P01037 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CST1P01037 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CST1P01037 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST1P01037 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST1P01037 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST1P01037 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST1P01037 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST1P01037 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST1P01037 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST1P01037 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST1P01037 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST1P01037 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST1P01037 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST1P01037 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST1P01037 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST1P01037 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST1P01037 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CST1P01037 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CST1P01037 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CST1P01037 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CST1P01037 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CST1P01037 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST1P01037 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST1P01037 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST1P01037 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST1P01037 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST1P01037 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST1P01037 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST1P01037 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CST1P01037 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CST1P01037 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CST1P01037 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms