Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD3O95983 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD3O95983 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD3O95983 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD3O95983 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD3O95983 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD3O95983 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD3O95983 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD3O95983 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD3O95983 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD3O95983 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD3O95983 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD3O95983 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD3O95983 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD3O95983 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD3O95983 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD3O95983 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD3O95983 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD3O95983 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD3O95983 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD3O95983 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD3O95983 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD3O95983 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD3O95983 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD3O95983 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD3O95983 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD3O95983 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD3O95983 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD3O95983 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD3O95983 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD3O95983 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD3O95983 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD3O95983 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD3O95983 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD3O95983 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD3O95983 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD3O95983 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD3O95983 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD3O95983 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD3O95983 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD3O95983 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD3O95983 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD3O95983 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD3O95983 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD3O95983 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD3O95983 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD3O95983 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD3O95983 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD3O95983 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD3O95983 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD3O95983 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD3O95983 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD3O95983 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD3O95983 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD3O95983 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD3O95983 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms