Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGDSO95455 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGDSO95455 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGDSO95455 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGDSO95455 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGDSO95455 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGDSO95455 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TGDSO95455 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TGDSO95455 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TGDSO95455 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGDSO95455 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGDSO95455 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGDSO95455 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGDSO95455 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGDSO95455 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGDSO95455 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGDSO95455 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGDSO95455 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGDSO95455 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGDSO95455 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGDSO95455 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGDSO95455 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGDSO95455 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGDSO95455 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGDSO95455 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGDSO95455 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGDSO95455 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGDSO95455 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGDSO95455 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGDSO95455 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGDSO95455 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGDSO95455 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGDSO95455 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGDSO95455 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGDSO95455 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGDSO95455 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGDSO95455 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms