Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD3O95274 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYPD3O95274 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms