Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM63AO94886 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM63AO94886 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms