Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASSF9O75901 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF9O75901 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms