Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KATNA1O75449 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KATNA1O75449 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KATNA1O75449 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KATNA1O75449 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KATNA1O75449 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms