Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRGAP2O75044 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms