Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MITFO75030 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MITFO75030 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MITFO75030 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MITFO75030 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MITFO75030 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MITFO75030 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MITFO75030 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MITFO75030 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MITFO75030 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MITFO75030 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MITFO75030 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MITFO75030 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MITFO75030 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MITFO75030 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MITFO75030 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MITFO75030 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MITFO75030 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MITFO75030 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MITFO75030 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MITFO75030 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MITFO75030 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MITFO75030 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MITFO75030 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MITFO75030 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MITFO75030 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MITFO75030 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MITFO75030 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MITFO75030 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MITFO75030 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MITFO75030 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MITFO75030 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MITFO75030 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MITFO75030 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MITFO75030 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MITFO75030 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MITFO75030 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MITFO75030 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MITFO75030 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MITFO75030 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MITFO75030 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MITFO75030 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MITFO75030 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MITFO75030 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MITFO75030 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MITFO75030 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms