Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN2BO60939 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN2BO60939 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN2BO60939 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN2BO60939 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms