Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBNO60934 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBNO60934 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NBNO60934 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NBNO60934 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NBNO60934 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBNO60934 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBNO60934 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBNO60934 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NBNO60934 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBNO60934 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBNO60934 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBNO60934 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBNO60934 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NBNO60934 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBNO60934 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBNO60934 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBNO60934 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NBNO60934 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBNO60934 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBNO60934 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBNO60934 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBNO60934 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBNO60934 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBNO60934 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NBNO60934 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBNO60934 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBNO60934 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBNO60934 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBNO60934 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBNO60934 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NBNO60934 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NBNO60934 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBNO60934 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBNO60934 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBNO60934 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NBNO60934 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBNO60934 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NBNO60934 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NBNO60934 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBNO60934 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBNO60934 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBNO60934 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBNO60934 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBNO60934 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBNO60934 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NBNO60934 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBNO60934 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBNO60934 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBNO60934 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBNO60934 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NBNO60934 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBNO60934 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NBNO60934 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBNO60934 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBNO60934 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBNO60934 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBNO60934 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NBNO60934 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBNO60934 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NBNO60934 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBNO60934 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBNO60934 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NBNO60934 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NBNO60934 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NBNO60934 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBNO60934 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NBNO60934 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBNO60934 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBNO60934 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBNO60934 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBNO60934 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NBNO60934 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBNO60934 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBNO60934 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBNO60934 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms