Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF13O43567 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF13O43567 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF13O43567 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF13O43567 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF13O43567 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF13O43567 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF13O43567 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF13O43567 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF13O43567 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF13O43567 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF13O43567 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF13O43567 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF13O43567 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF13O43567 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF13O43567 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF13O43567 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF13O43567 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF13O43567 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF13O43567 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF13O43567 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF13O43567 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF13O43567 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF13O43567 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF13O43567 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF13O43567 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF13O43567 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF13O43567 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF13O43567 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF13O43567 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF13O43567 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF13O43567 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF13O43567 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF13O43567 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF13O43567 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF13O43567 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF13O43567 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF13O43567 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF13O43567 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF13O43567 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF13O43567 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF13O43567 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF13O43567 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF13O43567 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF13O43567 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms