Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX2-8O15522 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-8O15522 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms