Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SYNJ2O15056 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
SYNJ2O15056 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNJ2O15056 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SYNJ2O15056 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
SYNJ2O15056 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
SYNJ2O15056 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SYNJ2O15056 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SYNJ2O15056 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SYNJ2O15056 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SYNJ2O15056 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
SYNJ2O15056 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SYNJ2O15056 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms