Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QKU1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QKU1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QKU1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QKU1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QKU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QKU1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QKU1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QKU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QKU1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QKU1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QKU1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QKU1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QKU1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QKU1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QKU1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QKU1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QKU1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QKU1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QKU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QKU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QKU1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QKU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QKU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QKU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QKU1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QKU1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QKU1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QKU1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QKU1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QKU1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QKU1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QKU1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QKU1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QKU1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QKU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QKU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QKU1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QKU1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QKU1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QKU1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QKU1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QKU1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QKU1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QKU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3QKU1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QKU1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QKU1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QKU1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QKU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QKU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QKU1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QKU1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QKU1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QKU1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QKU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QKU1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QKU1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QKU1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QKU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QKU1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QKU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QKU1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QKU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QKU1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QKU1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QKU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QKU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QKU1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QKU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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