Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM1B2RUZ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM1B2RUZ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms