Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VGLL3A8MV65 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms