Protein–RNA interactions for Protein: A6NLW8

DUXA, Double homeobox protein A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAA6NLW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUXAA6NLW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUXAA6NLW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUXAA6NLW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms