Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD8B2A6NJW9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms