Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC10BA6NIK2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC10BA6NIK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms