Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ZNF316A6NFI3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF316A6NFI3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms