Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3PXD2BA1X283 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3PXD2BA1X283 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms