Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTL3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTL3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GTL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1B0GTL3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GTL3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms