Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAP3K4Q9Y6R4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms